O BRDE Municípios atua diretamente no desenvolvimento local. A partir deste programa os municípios têm capacidade de investir em projetos que visem a qualidade de vida da sua população, esteja ela em área urbana ou rural. Para este programa, o BRDE disponibiliza linhas de crédito em Saneamento e Mobilidade, financia projetos relativos à drenagem urbana, resíduos líquidos e sólidos, pavimentação, iluminação ou ciclovias. Apoia também projetos de Infraestrutura social, rural e urbana, com o qual os municípios podem obter recursos que tenham como projeto, por exemplo, a construção de escolas, postos de saúde, centros comunitários, estradas, distritos industriais ou infraestrutura turística. Também tem como foco projetos de cidades inteligentes, promovendo conectividade, segurança, modernidade e desenvolvimento.